新疆奶牛戊型肝炎病毒RNA检测及序列分析

作     者：胡广东 马勋 

作者机构：石河子大学动物科技学院新疆石河子832003 

出 版 物：《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期：2010年第26卷第1期

页      面：27-32页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：国际科技合作项目(2006DFA33740) 国家自然科学基金(30760012) 新疆生产建设兵团科技局2006博士基金(2007JC15) 

主　　题：戊型肝炎病毒(HEV) 反转录套式聚合酶链式反应 奶牛 

摘      要：从新疆两个奶牛场的戊型肝炎病毒（Hepatitis E virus,HEV）抗体检测阳性的奶牛中分别采集牛粪便或肛拭子样品,利用反转录套式聚合酶链反应（RT-nPCR）检测所采集样品中的HEV RNA,结果来自第一个奶牛场的7份牛粪便样品为阳性,阳性率11.67%,来自第二奶牛场的1份肛拭子样品为阳性,阳性率为3.23%。将PCR扩增产物克隆、测序并进行序列分析,结果表明,对应于HEV ORF2 189bp核苷酸序列的8个牛源HEV基因组扩增片段的同源性为96.3%-100.0%,应当属于相同的基因型; 它们与HEV 1、2、3和4型ORF2 189bp核苷酸平均同源性分别为78.5%-86.4%,81.7%-83.8%,79.1%-85.3%和84.3%-95.8%,与4型的同源性最高达93.2%-95.8%。基于这些已测序核酸片段绘制的基因进化树显示：本研究中的8株牛源HEV ORF2 189bp核苷酸序列与HEV 4型人源C5株、猪源swC3与swXJ株位于同一进化枝上,同属HEV基因4型,提示新疆奶牛中可能存在HEV感染,并且奶牛可能是人类HEV传染源中除猪之外的新宿主。