利用实时定量PCR对瘤胃甲酸甲烷杆菌定量方法的建立与应用
Development and Application of a Real-Time PCR Approach for Quantification of Methanobacterium formicium in Rumen作者机构：中国农业科学院畜牧研究所反刍动物营养研究室 中国农业科学院畜牧研究所反刍动物营养研究室 北京100094
出 版 物：《中国农业科学》 (Scientia Agricultura Sinica)
年 卷 期：2006年第39卷第1期
页 面：161-169页
核心收录：
学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金：国家“十五”科技攻关重大专项资助(2002BA518A02)
摘 要：目的解决传统微生物评价方法存在的弊端,寻找快速、准确、灵敏的瘤胃微生物评价的新方法。方法利用实时定量PCR技术,以16SrDNA为靶序列,建立了瘤胃甲酸甲烷杆菌(Methanobacteriumformicicum)的分子定量方法。结果采用本文所设计的引物、探针以及相应的PCR反应体系,检测极限可达到30拷贝(15个甲酸甲烷杆菌),与传统检测方法相比要更为迅速、灵敏。采用实时定量PCR技术所测得的细菌数量与采用传统的最大或然数记数法所测的细菌数量具有很高的相关性(r=0.957,P0.01),表明采用实时定量PCR方法能够准确反映瘤胃微生物数量的变化。利用所建立的方法对利鲁杂交肉牛和荷斯坦奶牛瘤胃液中甲酸甲烷杆菌进行了定量检测。结果表明,利鲁杂交肉牛瘤胃液中的甲酸甲烷杆菌浓度是荷斯坦奶牛的5.6倍。结论利用实时定量PCR技术建立的瘤胃甲酸甲烷杆菌的分子定量方法能够准确反映瘤胃微生物数量的变化。
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