基于SSR荧光标记构建建兰品种核心种质
Construction of Core Collection of Cymbidium ensifolium Cultivars Based on SSR Fluorescent Markers作者机构:福建农林大学园林学院兰科植物保护与利用国家林业与草原局重点实验室
出 版 物:《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)
年 卷 期:2019年第46卷第10期
页 面:1999-2008页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 0901[农学-作物学] 0902[农学-园艺学] 0834[工学-风景园林学(可授工学、农学学位)]
基 金:国家自然科学基金项目(31700618) 福建省自然科学基金项目(2016J01703) 福建省种业创新与产业化工程项目(ZYCX-LY-2017005)
摘 要:以226个建兰品种为材料,应用16对SSR荧光引物进行扩增,基于等位基因最大法,按照93.36%、83.19%、71.68%、64.16%、54.42%、47.35%、32.30%、23.45%、17.26%、12.39%和8.41%等11个压缩比例逐步聚类,形成备选种质。结果表明,16对SSR荧光引物共检测到135个等位基因,平均观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性指数(H)、Shannon’s指数(I)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)和多态信息量(PIC)分别为8.5、3.218、0.584、1.228、0.617、0.384、0.539,表明建兰品种的遗传多样性丰富。各品种间的遗传多样性系数在0.64~1.0之间,在0.75处可分为4类,聚类结果客观反映出品种间的亲缘关系。经过对11个压缩比例形成的备选种质的对比,压缩比例32.30%为构建核心种质的最佳比例。t检验结果表明,构建的包含73个品种的核心种质与原始种质的遗传参数无显著差异,能充分代表原始种质的多样性。