马铃薯StPSKRs基因的克隆及其亚细胞定位分析

作     者：卢瑶 胡金雪 金鑫 陈越 陈勤 卢海彬 LU Yao;HU Jinxue;JIN Xin;CHEN Yue;CHEN Qin;LU Haibin

作者机构：西北农林科技大学农学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室陕西杨陵712100 西北农林科技大学食品科学与工程学院/旱区作物逆境生物学国家重点实验室陕西杨陵712100 

出 版 物：《西北植物学报》 (Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica)

年 卷 期：2019年第39卷第9期

页      面：1521-1527页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家自然科学基金(31601703) 西北农林科技大学启动经费(Z111021601) 

主　　题：马铃薯 植物磺肽素 植物磺肽素受体 生物信息学 亚细胞定位 

摘      要：该研究采用同源克隆与PCR扩增方法,从马铃薯品种‘Desiree’中克隆植物磺肽素受体基因StPSKR 1和StPSKR 2的全长cDNA,并对其进行生物信息学分析及亚细胞定位分析,为深入研究StPSKR 1和StPSKR 2基因在马铃薯生长发育和生物胁迫中的作用提供理论依据。结果发现:(1)通过同源克隆与PCR扩增获得StPSKR 1和StPSKR 2的全长cDNA片段,并将其克隆到pGWB5-GFP载体;测序结果显示这2个基因编码的蛋白质与数据库给定的蛋白质序列保持一致,表明成功克隆到StPSKR 1和StPSKR 2基因。(2)StPSKR 1位于马铃薯1号染色体上,cDNA全长3042 bp,编码1013个氨基酸,预测蛋白相对分子质量为112.16 kD,理论等电点6.27;StPSKR 2位于7号染色体,cDNA全长3135 bp,编码1044个氨基酸,相对分子量为114.99 kD,理论等电点6.19。(3)生物信息学分析显示,StPSKR1和StPSKR2都属于跨膜蛋白。(4)亚细胞定位结果显示,StPSKR1和StPSKR2均定位于细胞膜上。