REP-PCR及ERIC-PCR法对分离自海产品副溶血性弧菌分型分析

作     者：马月姣 孙晓红 赵勇 卢瑛 吴启华 潘迎捷 MA Yue-jiao;SUN Xiao-hong;ZHAO Yong;LU Ying;Vivian Chi-Hua WU;PAN Ying-jie

作者机构：上海海洋大学食品学院上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心上海201306 缅因大学食品科学与人类营养系美国欧洛诺04469 

出 版 物：《食品科学》 (Food Science)

年 卷 期：2013年第34卷第10期

页      面：263-267页

核心收录：

学科分类：08[工学] 082203[工学-发酵工程] 0822[工学-轻工技术与工程] 

基　　金：霍英东教育基金会第十一届高等院校优选课题(114035) 上海市科学技术委员会部分地方院校能力建设项目(11310501100) 上海市教育委员会重点学科建设项目(J50704) 

主　　题：副溶血性弧菌 tdh 肠内细菌基因组间重复序列分析 细菌基因外重复回文序列扩增 分型 

摘      要：目的:采用细菌基因外重复回文序列扩增(REP-PCR)和肠道细菌基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)两种方法对副溶血性弧菌2株标准株,13株实验室保存菌株和73株分离菌株共88株进行分子分型。方法:通过REP和ERIC-PCR指纹图谱扩增,利用NTsys-pc软件采用Dice系数对指纹图谱进行聚类结果分析。结果:所有供试菌株可通过此两种方法进行分型得到清晰的指纹图谱,并反映出副溶血性弧菌具有丰富的遗传多样性,REP-PCR扩增出5～9条分布在609～4200bp之间的条带,可将副溶血性弧菌分为5个群12类型,分辨指数达0.93,其中tdh+株在相似系数0.86时可聚类在第Ⅰ群;ERIC-PCR扩增出5～11条分布在400～7593bp之间的条带,将副溶血性弧菌分为7个群11个类型,分辨指数为0.94,其中tdh+株在相似系数0.76时可聚类在第Ⅰ群。结论:两种方法均显现出很好的分型能力,能够很好地将环境分离tdh+菌株和标准菌株聚类在一起,其中REP-PCR较ERIC-PCR重复性更好。