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环境因子对中国柽柳遗传变异的影响

Effects of environmental factors on population genetic diversity of Tamarix chinensis

作     者:孙丽坤 刘光琇 张宝贵 章高森 SUN Li-kun;LIU Guang-xiu;ZHANG Bao-gui;ZHANG Gao-sen

作者机构:甘肃农业大学甘肃兰州730070 中国科学院西北生态环境资源研究所甘肃兰州730000 太原师范学院山西晋中030619 

出 版 物:《草业学报》 (Acta Prataculturae Sinica)

年 卷 期:2019年第28卷第10期

页      面:178-186页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 071001[理学-植物学] 07[理学] 0818[工学-地质资源与地质工程] 0903[农学-农业资源与环境] 0901[农学-作物学] 0902[农学-园艺学] 0833[工学-城乡规划学] 0713[理学-生态学] 0834[工学-风景园林学(可授工学、农学学位)] 

基  金:甘肃省青年科技基金计划(18JR3RA181) 甘肃农业大学学校人才专项经费(2017RCZX-19)资助 

主  题:中国柽柳 核苷酸多样性 单倍型多样性 遗传分化 环境因子 

摘      要:分别以核糖体DNA(nuclear ribosomal DNA,nrDNA)的内转录间隔区(internal transcribed spacer regions,ITS)和两条叶绿体DNA(chloroplast DNA,cpDNA)片段—trnL-trnF,rps 16为分子标记,研究了20个自然分布的中国柽柳群体遗传变异与环境因子和地理距离间的相关性。结果表明:ITS序列(616 bp)中共发现了10个多态位点,定义了11种单倍型;总核苷酸多样性和总单倍型多样性分别为2.170和0.814。两个cpDNA分子标记片段的拼接序列(1542 bp)中共发现了14个多态位点,定义了16种单倍型,总核苷酸多样性和总单倍型多样性分别为0.500和0.586。ITS遗传多样性与地理、气候和土壤因子间相关性分析显示:海拔、温度和经度是影响中国柽柳群体遗传变异的主要因素。在低海拔、温暖和靠海近的湿润东部群体,ITS遗传多样性较高。而cpDNA的遗传变异与各种环境因子间没有显著的相关性。Mantel检测发现中国柽柳ITS的遗传变异与地理距离显著正相关,而cpDNA的遗传变异没有显著的地理渐变趋势,该结果进一步揭示了中国柽柳强大的种子流在降低群体间遗传分化上发挥了重要作用。

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