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甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因进化分析

Genetic characterization of neuraminidase gene of pandemic influenza A(H1N1) virus in Shandong province

作     者:刘倜 林艺 王爽 张圣洋 尹玉岩 李忠 王显军 毕振强 

作者机构:山东省疾病预防控制中心病毒性传染病防制所山东省传染病预防控制重点实验室济南250014 山东大学公共卫生学院 

出 版 物:《中国公共卫生》 (Chinese Journal of Public Health)

年 卷 期:2011年第27卷第1期

页      面:20-22页

学科分类:0710[理学-生物学] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 10[医学] 

基  金:山东省科技厅计划项目(2009GG10002054) 

主  题:甲型H1N1流感病毒 神经氨酸酶(NA) 高度保守 

摘      要:目的探讨2009年山东省甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(neuram inidase,NA)基因的进化及NA基因编码蛋白抗原性、酶活性位点、糖基化位点变异情况。方法对山东省分离的20株甲型H1N1流感病毒的NA基因序列,用MEGA 4.0软件进行基因进化分析和氨基酸序列分析。结果山东省2009年9月-2010年1月分离的20株甲型H1N1流感病毒NA基因的同源性均〉99.2%,其中有4株的同源性为100%;与疫苗株[A-Californ ia-07-2009(H1N1)]、国内推荐株[A-S ichuan-SWL1-2009(H1N1)]的同源性分别为99.1%~99.5%和99.1%~99.6%;有13个神经氨酸酶基因的氨基酸发生了替换,为21、23、25、42、43、60、76、94、106、122、248、307和351位;未发生神经氨酸酶蛋白275位H-Y的替换。结论山东省分离的甲型H1N1流感病毒NA基因高度保守,潜在抗原位点氨基酸分布相同;所有毒株的酶活性中心位点以及糖基化位点均高度保守;所有测定样本均未发生对达菲类药物的耐药性突变。

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