西昆仑山2个海拔位点可培养细菌多样性分析
Diversity of Culturable Bacteria Isolated from Two Altitudes in the West Kunlun Mountains作者机构:新疆大学生命科学与技术学院新疆乌鲁木齐830046 新疆医科大学基础学院微生物教研室新疆乌鲁木齐830011
出 版 物:《干旱区研究》 (Arid Zone Research)
年 卷 期:2011年第28卷第6期
页 面:1071-1080页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学]
基 金:新疆维吾尔自治区科技支疆项目(201091236) 国家自然科学基金(31060002)
主 题:可培养细菌 海拔高度 多样性指数 系统发育 菌种资源 昆仑山
摘 要:以西昆仑山2个海拔样点的土样为对象,利用(LB和TSA)2种培养基,基于16S rRNA基因序列的系统发育,采用纯培养法对其可培养细菌多样性进行研究。2样点中共分离到91株细菌,分为25个属,52个种。厚壁菌门(Firmicutes)占总菌数的48.75%,放线菌门(Actinobacteria)占36.25%,γ-变形菌亚门(γ-Proteobacteria)占15%。其中,Bacillus属(占所有菌株的27%)为优势菌群,Arthrobacter属(占15%),Pseudomonas属(占10%)为次优势菌群。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种,其典型菌株之间存在一定的遗传差异,16S rRNA基因序列相似性为98.2%~99.9%;其中至少有10个菌株(占所有菌株的11%)代表潜在的新分类单元(它们与最近源模式菌株的16S rRNA基因序列相似性低于97.8%)。分离到的细菌大部分与土壤、冰川、海洋、盐湖、沙漠、动物内脏等环境分离的细菌具有高度相似性。辛普森多样性指数(Simpson’s diversity index);香农-威纳指数(Shannon-Wie-ner index);香农-威纳均匀度指数(Shannon-Wiener’s evenness index)分析显示,高海拔地区(3 100 m)可培养细菌多样性高于低海拔地区(2 795 m),而高海拔地区可培养细菌的分布均匀度则低于低海拔地区。表明西昆仑山可培养细菌不仅具有丰富的多样性,还蕴藏着较多具有地域特点的新菌种资源。