基于共表达网络研究巨噬细胞在动脉硬化中的作用

作     者：赵宏群 张一骅 李琬 何月涵 吕俊杰 黄昊 陈丽娜 ZHAO Hongqun;ZHANG Yiye;LI Wan;HE Yuehan;LYU Junjie;HUANG Hao;CHEN Lina

作者机构：哈尔滨医科大学生物信息学院150081 

出 版 物：《国际免疫学杂志》 (International Journal of Immunology)

年 卷 期：2015年第38卷第5期

页      面：409-412页

学科分类：1002[医学-临床医学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金（61272388） 黑龙江省自然科学基金（F201237） 国家及黑龙江省大学生创新创业训练基金（201410226010）. 

主　　题：动脉粥样硬化 巨噬细胞 共表达网络 Biweight midcorrelation 

摘      要：目的探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化形成和发展中的作用机理。方法从GEO数据库中下载一组人类冠状动脉粥样硬化（AS）的单核细胞转录组基因表达谱数据。通过Bicor相关方法分别构建基于正常和疾病样本差异基因共表达网络，用ClusterOne挖掘疾病候选功能模块后进行富集分析，对模块之间重叠度及功能富集情况进行分析。结果在疾病和正常网络中分别得到3个功能相关模块，共富集到11个功能类，从正常到疾病状态中模块间基因存在差异，富集到的功能类也存在差异。结论不同模块中基因的突变、凋亡、磷酸化和去磷酸化等在巨噬细胞致AS过程中起着重要作用。