牙周炎组织中miRNA表达谱差异筛选及功能预测分析

作     者：王宝华 赵亦非 沈莉蓉 汪战红 孔晔 庄秦 WANG Bao-hua;ZHAO Yi-fei;SHEN Li-rong;WANG Zhan-hong;KONG Ye;ZHUANG Qin

作者机构：上海雅诺口腔门诊部 上海交通大学附属仁济医院口腔科 上海潍坊社区服务中心口腔科 上海厚诚口腔门诊部  5. 维乐口腔格林门诊部 

出 版 物：《上海口腔医学》 (Shanghai Journal of Stomatology)

年 卷 期：2019年第28卷第4期

页      面：408-411页

学科分类：1003[医学-口腔医学] 1002[医学-临床医学] 100302[医学-口腔临床医学] 10[医学] 

主　　题：hsa-miR-1260 hsa-miR-451 信号转导通路 牙周炎 

摘      要：目的:筛选牙周炎患者组织中的差异表达miRNA,探讨其生物学功能以及参与的信号通路。方法:通过对微阵列数据库GSE54710中的158例牙周炎患者和40例健康人的牙龈组织中的基因芯片数据进行生物信息学分析,筛选差异表达miRNA,并预测参与的生物学功能和信号通路。采用SPSS 19.0软件包对数据进行统计学分析。结果:5种miRNAs (hsa-miR-451、hsa-miR-223、hsa-miR-486-5p、hsa-miR-3917、hsa-miR-671-5p)显著上调,4种miRNAs(hsa-miR-203、hsa-miR-210、hsa-miR-1246、hsa-miR-1260)显著下调。其中,hsa-miR-1260的靶基因584个,hsa-miR-451的靶基因139个。KEGG通路富集分析显示,hsa-miR-1260靶基因显著富集到TGF-beta等12条信号通路,hsa-miR-451靶基因显著富集到17条信号通路。结论:得到牙周炎组织中miRNAs的表达谱,牙周炎诱导的hsa-miR-1260和hsa-miR-451可能在牙周炎的生理病理学中起到关键作用。