萝卜铁转运蛋白基因RsIRT1分子特征分析

作     者：贺晓燕 龚义勤 徐良 赖德强 温天彩 柳李旺 

作者机构：南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室/教育部园艺种质创新与利用工程研究中心/农业部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室/园艺学院江苏南京210095 

出 版 物：《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)

年 卷 期：2013年第36卷第6期

页      面：13-18页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31372064) 教育部科技研究重点项目(108068) 中央高校基本科研业务费专项资金项目(KYZ201209) 

主　　题：萝卜 IRT1基因 镉 表达分析 

摘      要：运用PCR和RT-PCR技术从萝卜中克隆出RsIRT1基因,其cDNA包含一个长度为1 038 bp的开放阅读框,编码345个氨基酸,蛋白质相对分子质量为36.37×103。TMHMM Server v2.0分析RsIRT1蛋白有8个跨膜结构域,推测为一种膜蛋白;蛋白序列同源分析表明,萝卜RsIRT1(AFJ05595)与拟南芥AtIRT1(XP-002869968)、遏蓝菜TcIRT1-P(CAL25151)的遗传距离最近。半定量RT-PCR表达分析表明,正常铁营养时RsIRT1基因在萝卜花瓣、花蕾、叶片和根中均不表达,缺铁胁迫及缺铁加镉(100 mg·L-1)胁迫下表达,且缺铁加镉胁迫下,叶片和根中RsIRT1的表达量均高于缺铁胁迫。研究结果表明RsIRT1基因受外源缺铁和镉胁迫所诱导,RsIRT1参与金属铁和镉的吸收和转运过程。