中国部分地区蝙蝠携带病毒的宏基因组学分析

作     者：杨凡力 王意银 郑文成 何彪 江廷磊 李莹莹 夏乐乐 冯烨 范泉水 涂长春 

作者机构：吉林大学畜牧兽医学院吉林长春130062 军事医学科学院军事兽医研究所吉林长春130122 成都军区疾病预防控制中心昆明云南650118 湖南省动物卫生监督所长沙湖南410007 东北师范大学吉林省动物资源保护与利用重点实验室吉林长春130024 

出 版 物：《生物工程学报》 (Chinese Journal of Biotechnology)

年 卷 期：2013年第29卷第5期

页      面：586-600页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 0831[工学-生物医学工程（可授工学、理学、医学学位）] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 0836[工学-生物工程] 071005[理学-微生物学] 10[医学] 

基　　金：NSFC云南省联合基金(No.U1036601)资助~~ 

主　　题：病毒宏基因组学 蝙蝠 病毒组 高通量测序 

摘      要：蝙蝠携带有60多种病毒,其中许多对人有高度致病性。为了解中国蝙蝠携带病毒的自然本底、蝙蝠病毒的多样性和挖掘潜在的病毒病原,通过基于Solexa高通量测序的病毒宏基因组学技术对从吉林、云南、湖南采集的蝙蝠组织进行病毒组学研究,获得了11 644 232条读长(Reads),并拼接出44 872条重叠序列(Contig)。通过核酸序列注释发现,其中8.2%(4 002/44 872)的重叠序列与病毒相关,能进一步注释到36个病毒科,包括19种脊椎动物病毒、6种植物病毒、4种昆虫病毒和4种噬菌体。通过对重叠序列的遗传进化分析、多序列比对显示,被注释为细小病毒、腺联病毒、博卡病毒、腺病毒、小双节RNA病毒等的重叠序列与已知病毒相似,部分序列却又呈现出明显的序列差异。通过对腺病毒和博卡病毒进一步的PCR扩增证实了此研究方法可靠。旨在了解我国蝙蝠携带病毒组的构成,对建立高效的野生动物源人兽共患病的监测方法提供参考。