4-巯乙基吡啶配基与IgG相互作用的分子模拟研究
Molecular Simulation of the Interactions between 4-Mercaptoethyl-pyridine Ligand and IgG作者机构：化学工程联合国家重点实验室浙江大学化学工程与生物工程学系杭州310027 绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地浙江工业大学杭州310032
出 版 物：《化学学报》 (Acta Chimica Sinica)
年 卷 期：2010年第68卷第16期
页 面：1597-1602页
核心收录：
学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100102[医学-免疫学] 10[医学]
基 金：国家自然科学基金(Nos.20776129 20976154) 新世纪优秀人才支持计划 绿色化学合成技术国家重点实验室培育基地开放研究基金资助项目
主 题：4-巯乙基吡啶 IgG 疏水性电荷诱导层析 结合模式 分子模拟
摘 要：4-巯乙基吡啶(MEP)是一种新型的疏水性电荷诱导层析(HCIC)配基,具有良好的抗体分离性能,采用分子模拟方法研究MEP配基与IgG间的分子相互作用,以探讨HCIC分离机制.先通过分子对接搜索IgG分子Fc片段A链的蛋白表面,确定12个可能与MEP结合的位点区域,然后用分子动力学模拟考察了其中6个位点的结合性能.结果表明,MEP在Fc-A链表面的结合具有疏水倾向性,pH中性条件下,MEP能稳定地结合在TYR319和LEU309附近的位点,并与两者形成氢键作用,该区域具有疏水性极强的口袋结构;其他位点的结合较不稳定,受MEP取向影响大.在pH4.0酸性条件下,原先稳定结合的MEP快速从Fc-A链表面脱离,主要原因是MEP和Fc间的静电排斥作用,以及疏水作用减弱和氢键结合的消失.通过分子模拟方法,从分子水平验证了HCIC独特的作用机理:疏水相互作用主导吸附,静电排斥作用协助解吸.
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