临床分离阿萨希毛孢子菌IGS1区克隆及RFLP分析

作     者：夏志宽 杨蓉娅 王文岭 敖俊红 王聪敏 张洁 

作者机构：北京军区总医院皮肤科100026 

出 版 物：《中华皮肤科杂志》 (Chinese Journal of Dermatology)

年 卷 期：2008年第41卷第8期

页      面：512-514页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金(30570099) 

主　　题：毛孢子菌属 序列分析 DNA 多态性 限制性片段长度 

摘      要：目的明确临床分离的5株阿萨希毛孢子菌（rasahii）基因间隔区（IGS1）的序列，分析rasahfi种内基因多态性。方法用玻璃珠法分别提取临床分离5株rasahi及标准对照株总DNA，用ITS及IGS1区特异引物，PCR扩增目的区域，IGS1区扩增产物纯化后进行克隆、测序，测序结果分别提交到基因库，获取登录号。用BLAST和CLUSTALX1．83软件对序列进行比对分析。分别用限制性内切酶HapⅡ、MboI、AluI、HhaI对ITS及IGS1区PCR产物进行酶切及RFLP分析。结果6株菌均成功扩增出长度约为540bp的ITS区及643bp的IGS1区基因片段，IGS1区序列相似性为97％～99％。RFLP分析发现，菌株BZP07003IGS1区HapⅡ酶切结果及菌株BZP07004IGSl区HhaI酶切结果与其他菌株不同，MboI及AluI酶切6株菌结果无差异，ITS区6株菌酶切结果无差异。结论rasahiiIGS1区种内存在差异。HhaI及HapⅡ可用于rasahii种内多态性的分析研究，临床分离5株菌存在3种酶切结果，初步提示rasahii临床分离株可能具有种内多态性及遗传差异。