7型腺病毒疫苗株序列测定及其六邻体特性分析

作     者：姜秀丽 王健伟 温乐英 石长信 洪涛 

作者机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所腹泻室北京100052 

出 版 物：《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期：2003年第17卷第4期

页      面：305-309页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100102[医学-免疫学] 10[医学] 

基　　金：国家863计划现代农业与生物技术领域资助项目(2001AA215011) 

主　　题：7型腺病毒疫苗株 Ad7v 六邻体 基因治疗 DNA序列 氨基酸 

摘      要：目的 完成7型腺病毒疫苗株(Ad7v)的全序列测定并阐明其六邻体特征。方法 克隆Ad7v基因组17.5-68.0 mu片段,应用Sanger双脱氧法进行DNA序列测定,将编码六邻体蛋白的核苷酸序列输入GenBank数据库中,获得录入号为AF515814。用CLUSTAL.V软件比较Ad7v与其他亚组及同一亚组腺病毒的六邻体蛋白的同源性,分析其抗原性的差异,同时用RasMo12.71软件预测Ad7v六邻体三维结构。结果Ad7v 17.5-68.0 mu由17 596个碱基组成。这段基因r链主要编码晚期基因L1、L2和L3,L链编码E2的一部分。六邻体编码多肽位于L3区,由934个氨基酸残基组成,与其他9个已知的六邻体蛋白序列进行多序列同源性比较,发现Ad7疫苗株与其他亚组腺病毒的同源性为86.8％(Ad4)-78.5％(Ad5)。在同一亚组中,Ad7疫苗株与Ad3同源性最高,高达95.1％。可变序列主要集中在7个高变区(HVRs),根据Ad2六邻体三维结构模型预测Ad7六邻体三维结构,发现可变区大部分位于六邻体顶端的Ⅰ1和Ⅰ2环中。结论 完成了Ad7v的全序列分析,其六邻体序列与Ad5、Ad2等其他亚组病毒有很大差异,这一结果为构建新型腺病毒载体打下了基础。