癌组织中的遗传不稳定性的RAPD分析
Genetic instability in cancer tissues analyzed by random amplified polymorphic DNA PCR作者机构:广东医学院附属医院中心实验室湛江524001 广东医学院病原生物学教研室湛江524203
出 版 物:《Chinese Medical Journal》 (中华医学杂志(英文版))
年 卷 期:2002年第115卷第3期
页 面:430-432页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
主 题:随机扩增多态性DNA 遗传不稳定性 新分子标志 肿瘤发展 限制性长度多态性
摘 要:目的 检测肿瘤发生发展过程中DNA和染色体的不稳定性及筛选与新的癌基因或抑癌基因相关的分子标志。方法 用 9个随机引物对 5种肿瘤共 12 8个样本进行RAPD分析 ,检测其DNA和染色体的不稳定性。不稳定性的扩增带被切割回收纯化 ,克隆 ,然后被标记为探针作Southern和Northern印迹杂交分析 ,再进一步测序分析。结果 在所有的癌组织标本中胃癌样本 5号和 3号显示出最高的遗传变异。这 5种癌组织中遗传不稳定性的平均检出率分别从 4 2 2 %到 4 9 4 %。每个随机引物的检测能力有极显著差异 ,分别从 2 7%到 6 8%不等。其中引物2最高达 6 8% ,引物 8最低 ,为 2 7%。图 2中的B带为一个单拷贝片段经RFLP分析后发现其在胃癌和结肠癌中是缺失突变 ,测序后 ,经查询是一个新的序列并被GeneBank收录 (登录号AF15 10 0 5 )。进一步研究显示它可能是一个新抑癌基因的调控元件部分 ,含有一个顺式作用的“CACA启动子 ,一个“GATA家族序列的增强子和一个转录起始密码子。结论 RAPD与其他方法结合使用能检测肿瘤发生过程中DNA和染色体的不稳定性 ,并筛选与新的癌基因或抑癌基因相关的分子标志。