P53基因三周期性与密码子偏好性的相关性
Relation between the 3-base periodicity of P53 gene and codon usage bias作者机构：江南大学理学院无锡214122
出 版 物：《物理学报》 (Acta Physica Sinica)
年 卷 期：2014年第63卷第4期
页 面：376-384页
核心收录：
学科分类：1002[医学-临床医学] 0805[工学-材料科学与工程（可授工学、理学学位）] 100214[医学-肿瘤学] 0704[理学-天文学] 10[医学]
基 金：国家自然科学基金(批准号:11271163) 中央高校基本科研业务费(批准号:JUSRP51317B)资助的课题~~
主 题：三周期性 偏好性 P53基因 同义密码子相对使用度
摘 要：为了进一步研究分析P53抑癌基因的性质,对P53基因的蛋白质编码区以及对应的mRNA的三周期性进行比较分析.通过同义密码子相对使用度和拟同义密码子相对使用度方法对其分别进行计算,分析了蛋白质编码区密码子的偏好性以及mRNA密码子的偏好性.结果表明:P53蛋白质编码区具有很强的三周期性,而对应的mRNA不具有三周期性;P53蛋白质编码区的密码子偏好G或C结尾的密码子程度强于对应的mRNA.说明P53基因密码子的偏好性与三周期性紧密相关,密码子的偏好程度影响着三周期性.进一步从生物角度诠释了P53蛋白质编码区和对应mRNA三周期性的异同.结合P53基因这一特性,有助于提高其基因识别的正确率,对P53基因的深入研究具有重要的意义.
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