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手性金属配合物Δ,Λ-[Ru(IP)_2dppz]^(2+)对含G:T错配的环丁烷嘧啶二聚体识别和部分构型修复的分子力学研究

Molecular Mechanics Study on the Recognition and Partial Structural Repair of Cyclobutane Pyrimidine Dimer Including Double G:T Mismatched Pairs by the Chiral Metal Complex Δ,Λ-[Ru(IP)_2dppz]^(2+)

作     者:常永龙 张翠萍 杨频 CHANG Yong-Long;ZHANG Cui-Ping;YANG Pin*

作者机构:山西大学分子科学研究所化学生物学与分子工程教育部重点实验室太原030006 

出 版 物:《化学学报》 (Acta Chimica Sinica)

年 卷 期:2007年第65卷第2期

页      面:116-122页

核心收录:

学科分类:081704[工学-应用化学] 07[理学] 070304[理学-物理化学(含∶化学物理)] 08[工学] 0817[工学-化学工程与技术] 0703[理学-化学] 

基  金:国家自然科学基金(Nos.20601018 30470408) 山西省自然科学基金资助项目 

主  题:金属配合物 环丁烷嘧啶二聚体 分子模拟 空间位阻 静电相互作用 

摘      要:环丁烷嘧啶二聚体(CyclobutanePyrimidineDimer,CPD)是紫外线对DNA损伤导致皮肤癌的首要环节,XPC-hHR23B是最早作为对CPD的损伤识别剂的,但其识别效率很低.本文首次采用分子力学方法模拟了一种新的手性金属配合物?,Λ-[Ru(IP)2dppz]2+对含G:T错配的CPD双螺旋DNA的识别作用.模拟结果显示:金属配合物[Ru(IP)2dppz]2+的两个手性异构体都对含G:T错配的CPD双螺旋DNA具有识别作用,识别的过程体现了很强的手性选择性、沟选择性和位点特异性.同时,我们发现:在Λ-[Ru(IP)2dppz]2+插入到CPD后,形成CPD的两个T碱基由原来的敞口形状部分地转为近平行状,使其在构型上得到初步的修复.

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