禾花鲤与建鲤肌间骨miRNAs测序与分析比较
MIRNAS SEQUENCING AND ANALYSIS OF INTERMUSCULAR BONE BETWEEN RICE FLOWER CARP AND JIAN CARP作者机构:广西水产科学研究院广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室
出 版 物:《水生生物学报》 (Acta Hydrobiologica Sinica)
年 卷 期:2019年第43卷第4期
页 面:757-762页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学]
基 金:广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费(GXIF-2016-20) 广西科技计划项目(16449-0602) 广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室开放课题(GXKLEYLA2016-1) 广西创新驱动发展专项资金课题(桂AA17204080-5)资助~~
摘 要:为了研究禾花鲤(Rice flower carp)肌间骨柔软的分子调控机制,采集禾花鲤和建鲤(Jian carp)的肌间骨进行micro RNAs (miRNAs)的高通量测序,并进行了生物信息学分析。从禾花鲤肌间骨的小RNA文库测序获得18 32 nt的高质量miRNA序列25474895条、鉴定出成熟miRNAs 595种,而从建鲤文库获得miRNA序列24625715条、成熟miRNAs 570种。表达差异分析结果显示,与建鲤相比,禾花鲤肌间骨中84个miRNAs呈上调表达、267个呈下调表达。禾花鲤下调表达的miRNAs中有7条为已报道的促进人类成骨的miRNAs,上调表达的miRNAs中有6条为已报道的抑制人类成骨的miRNAs。因此推测禾花鲤可能是通过下调表达促进成骨的miRNAs及上调表达抑制成骨的miRNAs来抑制成骨过程,从而维持其肌间骨细小及柔软的特性。研究为国内首次开展禾花鲤肌间骨发育的分子调控机制研究,为水产动物肌间骨发育的研究奠定了基础。