盐胁迫下杜鹃差异表达基因的cDNA-SCoT分析
Analysis of Different Expressed Genes of Rhododendrons Under Salinity Stress by cDNA-SCoT作者机构:南京林业大学风景园林学院南京210037 江苏省农业科学院休闲农业研究所南京210014
出 版 物:《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)
年 卷 期:2019年第46卷第6期
页 面:1192-1200页
核心收录:
学科分类:090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学]
基 金:国家自然科学基金项目(31601785) 江苏高校品牌专业建设工程项目(PPZY2015A063)
摘 要:土壤盐渍是限制杜鹃属(RhododendronL.)植物分布与园林应用的主要因素之一。为探究杜鹃在盐胁迫中的抗性分子机理,以2个杜鹃品种‘江南春早’(R.‘Jiangnan Chunzao’)和‘胭脂密’(R. obtusu‘Yanzhi Mi’)为材料,进行盐胁迫处理,然后采用cDNA-SCoT的方法进行差异表达基因的筛选。结果表明,40个引物能够扩增出90多条带,其长度在100~1 800 bp之间;筛选出32条差异明显的条带进行回收,连接转化,经测序得到了15条高质量的EST序列。其生物信息分析表明,杜鹃盐胁迫下的差异基因主要编码过氧化氢酶、LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g63430异构体X1、Shc相关蛋白、光系统Ⅱ蛋白D1以及PTS果糖转运蛋白亚基ⅡABC等功能性蛋白,涉及细胞结构、防御反应、代谢、能量代谢、信号转导、转运、转录等。