基于小RNA深度测序和RT-PCR检测侵染广东省冬种马铃薯的病毒

作     者：路秉翰 汤亚飞 于琳 佘小漫 邓铭光 何自福 Lu Binghan;Tang Yafei;Yu Lin;She Xiaoman;Deng Mingguang;He Zifu

作者机构：广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室 

出 版 物：《植物保护学报》 (Journal of Plant Protection)

年 卷 期：2019年第46卷第3期

页      面：604-610页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：广东省科技计划项目(2015A020209070) 广东省2017年省级现代农业产业技术推广体系建设项目(2017LM1079,2017LM4163) 

主　　题：马铃薯病毒病 小RNA深度测序 RT-PCR检测 病毒鉴定 

摘      要：为明确侵染广东省冬种马铃薯的病毒种类及优势病毒,结合小RNA深度测序技术及RTPCR检测方法,对采集于广东省冬种马铃薯7个主产区的189份疑似病样进行检测分析。结果表明,经小RNA深度测序技术检测马铃薯病毒病混合样,发现存在马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)、马铃薯S病毒(Potato virus S,PVS)和马铃薯卷叶病毒(Potato leaf-roll virus,PLRV)3种病毒。进一步设计3种病毒的特异性引物并利用国内已报道的其它5种马铃薯病毒的特异性引物进行RT-PCR检测,发现189份马铃薯病毒病疑似病样中仅检测到PVY、PVS和PLRV这3种病毒,检出率依次为75.13%、10.05%和4.76%,且3种病毒在马铃薯上还存在复合侵染,复合侵染率为14.19%,其中PVY在各马铃薯产区均可检测到。表明侵染广东省冬种马铃薯的病毒为PVY、PVS和PLRV,其中PVY是优势病毒。