贝类派琴虫和单孢子虫二重荧光定量PCR方法的建立
Development of a duplex real-time PCR assay for detection of Perkinsus and Haplosporidium in shellfish作者机构:广西兽医研究所广西南宁530001
出 版 物:《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)
年 卷 期:2010年第30卷第7期
页 面:917-921页
核心收录:
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:国家百千万人才工程人选专项资金项目(945200603) 广西科技攻关资助项目(桂科攻0630001-3M)
摘 要:根据基因库中派琴虫和单孢子虫基因组的保守序列,设计了2对特异性引物和2条用不同荧光基团标记的TaqMan探针。对反应条件和试剂浓度进行优化,建立能够同时检测派琴虫和单孢子虫的二重荧光定量PCR方法。该方法特异性好,对派琴虫和单孢子虫的检测敏感性分别达到400和40个模板拷贝数;此外抗干扰能力强,对派琴虫和单孢子虫不同模板浓度进行组合,仍可有效地同时检测这2个原虫。对广西沿海的49份贻贝病料进行检测,结果派琴虫阳性率为16.3%,检测的派琴虫含量为2.38×106~9.21×102拷贝/μL;提示派琴虫广泛存在于中国南方沿海的养殖贝类中,建立的荧光定量PCR方法可以用于贝类派琴虫的临床快速检测。该方法对单孢子虫检测的敏感性比派琴虫高,而49份贻贝病料未检出单孢子虫,提示需要进行更多临床样品的检测。