基于集群的代谢网络计算平台研究

作     者：贾璐 罗若愚 刘谦 李亦学 骆清铭 Jia Lu;Luo Ruoyu;Liu Qian;Li Yixue;Luo Qingming

作者机构：华中科技大学生物医学光子学教育部重点实验室 湖北省生物信息与分子成像重点实验室湖北武汉430074 上海生物信息技术研究中心上海200233 

出 版 物：《计算机应用与软件》 (Computer Applications and Software)

年 卷 期：2008年第25卷第2期

页      面：45-46,51页

学科分类：08[工学] 0835[工学-软件工程] 081201[工学-计算机系统结构] 081202[工学-计算机软件与理论] 0812[工学-计算机科学与技术（可授工学、理学学位）] 

基　　金：国家科技攻关计划(2005BA711A04) 教育部科技基础条件平台项目(505010) 

主　　题：Linux集群 并行计算 负载平衡 消息传递接口 

摘      要：在生物代谢网络研究中,为提供面向多用户的高性能计算服务,开发了基于Linux计算机集群的代谢网络模拟W eb计算平台。该平台以集群为密集计算后台,以重建心肌细胞能量代谢网络为算例,采用集中式任务调度模型、加权结合轮询法的负载平衡技术以及消息传递接口并行编程模型,实现了对多用户并发任务的处理。通过实例应用和调度监控,验证了该平台在代谢网络模拟中的可用性,以及集群服务器并行处理多任务的有效性。