牛病毒性腹泻病毒内标双重TaqMan荧光RT-PCR方法的建立及初步应用
Establishment and application of the duplex TaqMan real-time RT-PCR with internal control for bovine viral diarrhea virus detection作者机构:新疆出入境检验检疫局新疆乌鲁木齐830063 新疆农业大学新疆乌鲁木齐830052
出 版 物:《中国预防兽医学报》 (Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine)
年 卷 期:2014年第36卷第8期
页 面:646-650页
核心收录:
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:新疆自治区高技术研究发展项目(201010101201141147) 国家质量监督检验检疫总局科研项目(2011IK011 2011IK017)
主 题:牛病毒性腹泻病毒 内标 共扩增 TaqMan荧光RT-PCR
摘 要:为建立牛病毒性腹泻病毒(BVDV)内标双重TaqMan荧光RT-PCR方法,本研究根据BVDV 5'-UTR区序列设计引物和荧光标记探针,通过重叠延伸PCR(SOE-PCR)扩增获得内标模板,经体外转录得到可以作为内标物的cRNA。经反应条件的优化,建立了BVDV内标双重TaqMan荧光RT-PCR检测体系。结果表明:当cRNA浓度为103拷贝/μL时,二者均有较好的扩增曲线;该方法对I型BVDV的检测灵敏度为0.25 TCID50,对II型BVDV的检测灵敏度为2.5 TCID50;利用该方法对猪瘟病毒等其他相关核酸的检测结果均为阴性;重复性检测Ct值变异系数为0.54~4.73。对506份临床样品检测,结果有23份样品为阳性,阳性样品检出数量和编号与不含内标的单一荧光RT-PCR方法完全一致,表明该方法可以用来对BVDV进行准确、快速检测,并且可以对检测结果进行质量监控。