拟南芥冷害胁迫下基因表达谱的统合分析

作     者：徐兆华 吴为人 XU Zhaohua;WU Weiren

作者机构：浙江大学农业与生物技术学院浙江杭州310058 福建农林大学作物科学学院福建福州350002 

出 版 物：《华南农业大学学报》 (Journal of South China Agricultural University)

年 卷 期：2013年第34卷第4期

页      面：511-516页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：973项目(2004CB117306) 

主　　题：冷胁迫 微阵列 差异表达基因 统合分析 

摘      要：对4套不同来源的拟南芥冷胁迫芯片试验数据进行了统合分析,并与各试验单独分析的结果进行了比较.结果表明,那些在2个或2个以上试验中被同时检测到的较可靠的差异表达基因(Differentially expressed gene,DEG)大多数都能被统合分析检测出来,而那些只在1个试验中被检测到的较不可靠的DEG则大约只有1/4被统合分析检测到,说明统合分析适合于检测较可靠的DEG.在统合分析检测到的DEG中,约有9%是未被单独分析检测到的,其中包含6个与冷害胁迫直接相关的基因,说明统合分析还可以检测到被单独分析忽略的DEG.基因本体和启动子基序分析显示,统合分析检测到的DEG确实与冷胁迫有着密切的关系.