2009~2011年上海地区部分急性呼吸道感染人群中肠道病毒流行规律分析
Epidemic and molecular characteristics of enterovirus in acute respiratory tract infection patients in Shanghai,China,2009-2011作者机构:上海市公共卫生临床中心上海201508
出 版 物:《微生物与感染》 (Journal of Microbes and Infections)
年 卷 期:2015年第10卷第6期
页 面:351-358页
学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学]
基 金:"十二五"国家科技重大专项(2012ZX10004211)
摘 要:本文旨在探讨上海地区急性呼吸道感染(ARTI)病例中肠道病毒的病原谱构成和分子流行病学特征。收集2009年5月-2011年4月上海3家哨点医院住院或门诊的2 282例ARTI病例的鼻咽拭子标本,用RV15试剂盒检测常见的呼吸道病原,对肠道病毒(EV)阳性标本用半套式聚合酶链反应(PCR)扩增病毒结构蛋白VP1基因片段,测序并进行基因分型。结果显示,共检测出34份(1.49%)肠道病毒阳性标本。其中检出率最高的为柯萨奇病毒A2型(CVA2)和柯萨奇病毒B5型(CVB5),各有6例(17.6%);CVA5有5例(14.7%)。不常见的CVA21和EV68分别有2例和1例。由肠道病毒VP1区5’端310个核苷酸序列构建的CVA2、CVA5、CVB5、CVA21和EV68系统进化树显示,2009-2010年CVA2上海株与2株北京地区2009年代表株高度同源(98.1%),CVA5上海株与2007-2009年中国大陆地区流行株高度同源(99.7%),CVB5上海株与2009年大陆地区流行株高度同源(99.7%),CVA21上海株与2002-2008年中国大陆地区流行株高度同源(99.4%),EV68上海株与2006-2008年北京地区流行株高度同源(96.6%)。本研究显示,上海地区2009-2011年ARTI患者中肠道病毒以CVA2、CVB5、CVA5为主,也有不常见的CVA21和EV68。进化关系分析显示,CVA2、CVA5、CVA21和EV68上海株序列均与2009年以前国内流行株高度同源。