血管内皮细胞生长因子受体2抑制剂三维药效团模型的构建
Construction of 3D pharmacophore model of vascular endothelial growth factor receptor 2 inhibitors作者机构:第二军医大学药学院药物化学教研室上海200433 成都军区总医院药剂科成都610083
出 版 物:《第二军医大学学报》 (Academic Journal of Second Military Medical University)
年 卷 期:2012年第33卷第7期
页 面:759-762页
核心收录:
学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 10[医学]
主 题:血管内皮生长因子受体2 抑制剂 药效团模型 抗肿瘤
摘 要:目的构建血管内皮细胞生长因子受体2(VEGFR-2)抑制剂的三维药效团模型,为设计新型抑制剂建立理论模型。方法应用Discovery Studio 2.5中的Catalyst模块,选取已确证结合于VEGFR-2活性腔、结合模式一致、抑制活性跨度5个数量级、结构具有多样性的30个抑制剂,其中21个分子作为训练集,余9个分子作为测试集产生三维药效团模型。结果最优药效团模型由1个氢键受体、2个疏水中心、1个芳环平面和4个排斥体积组成,预测相关性R为0.89。结论交叉验证结果表明药效团模型具有较好的预测能力,可用于数据库搜索筛选结构新颖的抑制VEGFR-2的先导化合物。