识别表达不稳定的基因

作     者：杨昆 李建中 徐德昌 戴国骏 YANG Kun;LI Jian-Zhong;XU De-Chang;DAI Guo-Jun

作者机构：杭州电子科技大学计算机学院浙江杭州310018 哈尔滨工业大学计算科学与技术学院黑龙江哈尔滨150001 

出 版 物：《软件学报》 (Journal of Software)

年 卷 期：2010年第21卷第9期

页      面：2148-2160页

核心收录：

学科分类：081203[工学-计算机应用技术] 08[工学] 0835[工学-软件工程] 0812[工学-计算机科学与技术（可授工学、理学学位）] 

基　　金：国家自然科学基金No.60903086 浙江省自然科学基金No.Y1080973~~ 

主　　题：微阵列 基因表达数据分析 整数规划 差异表达基因 

摘      要：提出集成分析来自相同研究问题的不同数据集来识别表达不稳定的基因.把这一问题形式化为一个非线性整数规划问题,三个启发式的算法被提出来求解这一优化问题;进一步地设计了一个统计量来度量基因的不稳定表达程度.提出的方法应用于两个真实数据,实验结果显示:所识别的不稳定基因在两个数据中的表达不一致;利用表达不稳定基因可以提高差异表达基因的筛选结果,而去除表达不稳定基因可以有效地提高微阵列数据分类.实验结果表明,提出的方法是有效的,并且表达不稳定基因可以为微阵列数据分析提供有价值的信息.