蛋白质与线性DNA片断结合过程中的末端效应(英文)
End Effects during the Binding of Protein to Linear DNA Fragments作者机构:北京大学理论生物学中心、物理学院北京100871
出 版 物:《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)
年 卷 期:2010年第26卷第7期
页 面:2007-2014页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 0703[理学-化学] 0702[理学-物理学]
基 金:supported by the National Natural Science Foundation of China(10634010,10721403) National Key Basic Rescarch Program of China(2009CB918500)~~
主 题:末端效应 DNA-转录因子相互作用 Mnt阻遏蛋白 表面等离子共振
摘 要:各种体外实验技术被广泛地用来研究DNA-蛋白质之间的相互作用,但体外和体内实验一个最明显的区别是实验使用的DNA片段远远短于基因组DNA,因而多出了大量线性DNA分子末端.末端问题曾倍受关注,若干研究小组在不同系统中对其进行了研究,但结果却并不一致,甚至完全相反.本文利用表面等离子共振技术(SPR)对一系列不同长度非特异DNA和Mnt阻遏蛋白结合和解离过程进行实时监测,结果表明该蛋白在线性DNA分子末端有比内部位点更高的解离速率.通过考察在不同位点含有特异序列的DNA与Mnt阻遏蛋白的结合过程,发现线性DNA分子末端在一定距离内会直接影响DNA与该蛋白的特异性结合.