1株Ⅰ类新基因型新城疫病毒的基因组特性分析
Genomic analysis of one new genotype Class Ⅰ Newcastle disease virus isolated from China作者机构:中国动物卫生与流行病中心山东青岛266032 扬州大学兽医学院江苏扬州225009
出 版 物:《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)
年 卷 期:2019年第39卷第1期
页 面:46-51页
学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学]
基 金:国家重点研发计划资助项目(2016YFD0500800) 公益性行业(农业)科研专项资助项目(201303033)
摘 要:为了研究我国新型新城疫病毒的分子流行病学特性,对2016年从主动监测中分离到的1株新出现的鸭源新城疫病毒(duck/China/NX2209/2016)进行了基因组测序和遗传进化分析。序列分析结果显示该分离株全长15 198nt,F基因ORF全长为1 662bp,共编码553个氨基酸,裂解位点处的氨基酸为:^(112) ERQERL^(117),符合低致病性新城疫病毒特征。同源性分析表明该新型毒株同北美分离株具有较高的同源性。F基因高变区进化分析结果显示,该病毒属于ClassⅠ,但不属于基因型1~10,为新型毒株。完整F基因进化树结果显示,该病毒属于基因1c亚型,与北美分离株高度同源。