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脐血HLA-A位点PCR-SBT分型的研究

HLA-A gene polymorphism detected by high-resolution sequence-based typing in 547 cord blood units

作     者:吴洁莹 廖灿 汤雪薇 李焱 杨昕 黄以宁 WU Jie-ying;LIAO Can;TANG Xue-Wei;LI Yan;YANG Xin;HUANG Yi-Ning

作者机构:广州市妇婴医院广州脐血库510180 

出 版 物:《中华微生物学和免疫学杂志》 (Chinese Journal of Microbiology and Immunology)

年 卷 期:2005年第25卷第7期

页      面:559-563页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基  金:广东省科委重点科技攻关课题 广东省卫生厅"五个一工程"重大科研项目(穗卫科学1996-23) 广州市科委重点攻关课题(96-Z-64-1和99-Z-008-01) 广州市卫生局重点攻关项目 

主  题:HLA-A分型 PCR-SBT 脐血库 无亲缘关系供者脐血移植 HLA分型 T分型 中华(上海)骨髓库 HLA-A等位基因 位点 DNA测序技术 

摘      要:目的建立HLA-A位点等位基因的PCR-SBT高分辨分型方法,探讨DNA测序技术在脐血库样本HLA分型中的应用价值。方法利用PCR产物直接测序,对广州脐血库保存的547份脐血样本进行HLA-A位点2、3、4外显子的序列分析,由分型结果得出基因频率,与中华(上海)骨髓库北方人群、上海地区人群及德国白种人进行比较。结果采用PCR-SBT分型方法并结合分析软件确定了全部样本的HLA-A基因型,广州地区人群HLA-A等位基因以A*110101(30.8%)最为常见,其后依次是A*24020101/02L(16.18%)、A*0207(11.88%)、A*3303(9.42%)。A*110101在广州汉族人群中出现的频率明显高于中华(上海)骨髓库北方人群,而A*010101、A*3001明显低于后者;在HLA-A2亚型人群中,A*020101在广州、上海两地汉族人群中的频率明显低于德国白种人,而广州汉族人群中A*020101与A*0206均明显低于上海汉族人,但A*0203明显高于后者。结论基于核酸序列测定的HLA分型技术能够直接、准确、快速地进行高分辨分型,将有助提高无亲缘关系供者脐血移植的临床效果。改进实验条件、升级分型软件,可以降低试剂成本和节约时间。

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