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土壤宏基因组的提取及基于免培养技术分析细菌16S rDNA

Preparation of Metagenome from Soil and Analysis on the Sequenceof a Bacteria 16S rDNA by Culture-independant Method

作     者:方光伟 洪雪梅 蔡丽希 彭锟 林毅 FANG Guang-wei;HONG Xue-mei;CAI Li-xi;PENG Kun;LIN Yi

作者机构:华侨大学生物工程与技术系福建泉州362021 华侨大学信息科学与工程学院福建泉州362021 

出 版 物:《江西农业大学学报》 (Acta Agriculturae Universitatis Jiangxiensis)

年 卷 期:2005年第27卷第4期

页      面:505-507页

学科分类:07[理学] 0713[理学-生态学] 

基  金:福建省自然科学基金项目(B0510011) 福建省青年科技人才创新项目(2003J024) 

主  题:土壤宏基因组 提取 16S rDNA 免培养 

摘      要:采用CTAB-SDS-冻融法和玻璃粉吸附法提取土壤宏基因组(metagenome),经琼脂糖凝胶电泳后用回收试剂盒对其进行纯化。以细菌16SrDNA通用引物从宏基因组中扩增出V8和V9两个高变区,回收纯化后与克隆载体pMD18-T连接,转化大肠杆菌DH5α,随机挑取一个阳性克隆菌进行序列测定,经BLAST分析表明该序列所代表的是一个不动杆菌属(Acinetobacter)细菌。本研究结果为分析土壤微生物种群结构和直接从土壤中分离功能基因奠定了基础。

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