木薯果胶甲基酯酶抑制因子MePMEI1的生物信息学分析
Bioinformatics Analysis of Pectin Methylesterase Inhibitor MePMEI1 from Manihot esculenta Crantz作者机构:海南大学热带农林学院海口570228 中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室海口571101
出 版 物:《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)
年 卷 期:2019年第38卷第3期
页 面:1186-1192页
核心收录:
学科分类:0831[工学-生物医学工程(可授工学、理学、医学学位)] 0711[理学-系统科学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0901[农学-作物学]
基 金:海南省重点研发计划(ZDYF2017073) 国家自然科学资金(No.31601359 No.31600196 No.31671767) 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-11-HNGJC) 中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630052016004 1630052-015014)共同资助
主 题:木薯 果胶甲基酯酶抑制因子 MePMEI1 生物信息学
摘 要:为探讨木薯MePMEI1的分子结构特征。通过PCR扩增和测序技术及生物信息学分析工具对木薯MePMEI1基因进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明木薯MePMEI1基因编码区全长609 bp,编码202个氨基酸残基;MePMEI1基因编码蛋白分子量21.78 k D,理论等电点(pI)约为5.51;生物信息学预测发现,木薯MePMEI1蛋白是稳定的亲水蛋白;具有跨膜区为分泌蛋白;含有1个PMEI结构域,1个糖基化位点,31个磷酸化位点;二、三级结构以α螺旋和无规则卷曲为主。该蛋白的生物功能可能与细胞被膜、酶和生长因子等相关。木薯MePMEI1基因的生物信息学分析为进一步研究其遗传特性和生理生化机制提供了理论依据。