拟诺卡氏菌线型质粒pNPL1的测序和分析

作     者：田新莉 钟莉 覃重军 TIAN Xin-Li;ZHONG Li;QIN Zhong-Jun

作者机构：中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所合成生物学重点实验室上海200032 

出 版 物：《微生物学通报》 (Microbiology China)

年 卷 期：2014年第41卷第7期

页      面：1376-1381页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(No.31121001) 

主　　题：拟诺卡氏菌 线型质粒 测序 分析 

摘      要：【目的】检测和分析稀有放线菌中新的线型质粒。【方法】从植物内生菌中分离链霉菌之外的放线菌菌株,检测、测序和分析线型质粒。【结果】从中草药植物紫花前胡的叶片中分离到一株内生放线菌25L-1-1c,经过16S rRNA基因序列比对属于拟诺卡氏菌。从该菌株中检测到一个约25 kb的线型质粒pNPL1。克隆和测序了pNPL1新的端粒,含有多个小的回文序列。测序获得全长为24 621 bp的线型质粒pNPL1,预测编码22个基因,其中2个基因与链霉菌质粒的端粒复制基因同源,1个基因与链霉菌质粒主要的接合转移基因相似,其余19个基因为未知功能。携带pNPL1端粒复制基因的质粒不能转化变铅青链霉菌,暗示需要发展拟诺卡氏菌的遗传操作系统。【结论】这是首次在拟诺卡氏菌中发现和描述线型质粒。