主成分分析在基因芯片分析中的应用

作     者：王强 许红民 

作者机构：解放军总医院北京100853 

出 版 物：《军医进修学院学报》 (Academic Journal of Pla Postgraduate Medical School)

年 卷 期：2005年第26卷第2期

页      面：145-147页

学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 100103[医学-病原生物学] 071007[理学-遗传学] 10[医学] 

主　　题：基因芯片 生物信息学分析 PCA 基因表达 分子生物学研究 基因功能 综述 维度 克服 合理 

摘      要：随着分子生物学研究的深入,基因芯片已成为后基因组时代基因功能分析的最重要技术之一。如何从高通量、高维度、多变量的基因芯片中挖掘可靠且有用的信息,是基因芯片生物信息学分析的瓶颈问题。主成分分析(principalcompo nentsanalysis,PCA)利用降维的思想,在不丢失原始数据信息的情况下,寻找多变量线性组合的综合因子,合理地降低基因表达空间的有效维度。克服其他基因芯片生物信息学分析方法的局限性,为基因芯片的数据挖掘提供了新的启示。笔者就基因芯片常用生物信息学分析方法的局限性和PCA在基因芯片中的应用作一综述。