融水小型猪线粒体DNA结构和系统进化的分析

作     者：徐嘉悦 施赫赫 王绪敏 高翔 余细勇 于军 唐小江 XU Jia-yue;SHI He-he;WANG Xu-min;GAO Xiang;YU Xi-yong;YU Jun;TANG Xiao-jiang

作者机构：中国科学院北京基因研究所北京100101 广东省医学实验动物中心广东佛山528248 广东贝格生物科技有限公司广东佛山528100 南京大学模式动物研究所南京210061 广东省医学科学院广州510060 

出 版 物：《中国比较医学杂志》 (Chinese Journal of Comparative Medicine)

年 卷 期：2015年第25卷第3期

页      面：28-34,F0002页

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：国家重大研究计划项目(2011CB944101) 国家自然科学基金重点项目(81120108003 81330007) 

主　　题：融水小型猪 线粒体DNA 系统进化分析 遗传多样性 

摘      要：目的研究融水小型猪的线粒体DNA结构和系统进化关系。方法选取了全基因组鸟枪法的测序策略对融水小型猪的外周血液样本进行测序,使用Illumina基因组分析测序技术构建paired-end文库进行末端测序,最后进行拼接及分析。结果融水小型猪的完整线粒体序列呈环形,总长为16888 bp,由13个编码蛋白基因、22个转运RNA和两个核糖体RNA构成。线粒体DNA的GC含量约为44%。系统进化分析、遗传多样性分析和中性检验证明了,在融水小型猪、兰屿猪、海南野猪和滇南7号这一类群中,发生了种群扩张。结论融水小型猪是中国传统猪种中比兰屿猪更为古老的小型猪。