应用MGB荧光探针技术确定猪KIT基因拷贝重复数

作     者：王韬 唐辉 曾勇庆 李晓宁 闫超 董林松 于希江 WANG Tao;TANG Hui;ZENG Yong-qing;LI Xiao-ning;YAN Chao;DONG Lin-song;YU Xi-jiang

作者机构：山东农业大学动物科技学院泰安271018 

出 版 物：《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期：2011年第42卷第3期

页      面：437-441页

核心收录：

学科分类：090602[农学-预防兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：山东省中青年科学家奖励基金(2008BS07009) 山东省科技攻关(2009GG10009036) 国家863重大专项(2008101002) 

主　　题：猪 显性/KIT位点 拷贝数 MGB探针 荧光定量PCR 

摘      要：旨在建立一种简便、快速检测猪KIT基因拷贝重复数(CNVs)的方法并应用于未知样品的检测。在KIT外显子2中设计TaqMan-MGB探针和引物,建立荧光实时定量PCR检测KIT基因CNVs的方法。结果表明,TaqMan-MGB探针扩增KIT基因目的片段,不同DNA梯度浓度Ct值差异极显著(P0.001),变异系数低(0.12%～0.26%);KIT与内标基因ESR的扩增效率相差只有2.4%;采用聚类分析推测了待测的50枚样品KIT的CNVs分别归属于2、3、4、5、6个拷贝。本研究建立的TaqMan-MGB探针实时荧光定量PCR检测KIT基因CNVs的方法,具有简便、快速、特异性和稳定性好的特点,适合于普通实验室应用。