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p-SAGE:基因集合的参数统计分析方法(英文)

p-SAGE:Parametric Statistical Analysis of Gene Sets

作     者:黄波 李文婷 李雯 夏雪峰 孙之荣 HUANG Bo;LI Wen-Ting;LI Wen;XIA Xue-Feng;SUN Zhi-Rong

作者机构:清华大学生物信息与系统生物学研究所生物信息学教育部重点实验室生物膜与膜技术国家重点实验室清华大学生物科学与技术系北京100084 

出 版 物:《生物化学与生物物理进展》 (Progress In Biochemistry and Biophysics)

年 卷 期:2009年第36卷第11期

页      面:1415-1422页

核心收录:

学科分类:02[经济学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 070103[理学-概率论与数理统计] 090102[农学-作物遗传育种] 0710[理学-生物学] 0202[经济学-应用经济学] 020208[经济学-统计学] 0714[理学-统计学(可授理学、经济学学位)] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 0701[理学-数学] 

基  金:supported by Hi-Tech Research and Development Program of China (2006AA020403) National Basic Research Program of China (2009CB918801) The National Natural ScienceFoundation of China (30770498)~~ 

主  题:参数统计分析方法 基因集合 反常基因 

摘      要:肿瘤的发生与发展通常是由重要的细胞通路表达水平的反常导致的.尽管目前已经有很多工作利用基因表达谱数据以及一些其他的先验知识来寻找那些与肿瘤相关的基因集合,但还是没有一个恰当的基因集合的统计学方法.大多数研究都是直接将单基因的检验方法直接应用到基因集合上来.提出了基因集合的参数统计分析方法(p-SAGE),这个方法应用到大脑肿瘤的实验中,识别了许多显著的基因集合.一些新发现的基因集合是与信号转导和免疫相关的.这个简便有效的方法可以得出有生物学意义的结果.

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