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炭疽芽孢DNA适配子结构与长度对亲和力的影响

Relationship between the secondary structure of an aptamer and its binding affinity to Bacillus anthracis spores

作     者:甄蓓 宋亚军 郭兆彪 王津 俞守义 杨瑞馥 

作者机构:第一军医大学流行病学教研室广东广州510515 军事医学科学院微生物流行病研究所国家生物医学分析中心分析微生物学实验室北京100071 

出 版 物:《第四军医大学学报》 (Journal of the Fourth Military Medical University)

年 卷 期:2002年第23卷第16期

页      面:1467-1470页

学科分类:1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基  金:"十五"全军医药卫生科研基金资助项目 ( 01MA 0 81) 

主  题:炭疽芽孢 DNA 适配子 结构 长度 亲和力 炭疽芽孢杆菌 

摘      要:目的 研究炭疽芽孢适配子结构与长度变化对其与芽孢之间亲和力的影响 .方法 人工合成 f77- 1适配子序列 ,并构建在其 7条突变体序列 ,将这些寡核苷酸序列分别与炭疽芽孢结合 ,利用 TMB显色系统判断读取吸光度 A值 ,确定各序列与芽孢间亲和力大小 ;同时通过核酸序列分析软件包模拟各序列的二级结构 ,推断适配子的结构与亲和力之间的关系 .结果 适配子 f77- 1与突变体中的 f77- 3与芽孢亲和力较好 ,约是突变体中 f77- 4亲和力的 1 1倍 ,二级结构显示 :f77- 1 ,f77- 3都具有茎环或发卡结构 ,且 3 端都有连续 3个G.结论 适配子 5 端的茎环结构和发卡结构是这些寡核苷酸序列与芽孢结合的结构基础 ,3 端的连续 3个

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