番茄LeABI3基因的生物信息学分析

作     者：范晶 黄明远 李仲芳 梁梓 伏秦超 雷常安 Fan Jing;Huang Mingyuan;Li Zhongfang;Liang Zi;Fu Qinchao;Lei Changan

作者机构：乐山师范学院化学与生命科学学院乐山614004 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2009年第25卷第11期

页      面：92-97页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0902[农学-园艺学] 090102[农学-作物遗传育种] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：四川省教育厅基金(08zb051) 乐山师范学院科研启动项目(Z0858) 峨眉山生物多样性保护与利用研究所科研项目(08S04) 

主　　题：番茄 LeABI3基因 生物信息学 

摘      要：对所克隆到的番茄LeABI3基因测序结果进行序列分析,发现得到LeABI3基因的2种转录本。应用生物信息学的方法和工具对LeABI3蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域和同源树进行分析,结果表明此蛋白是包含一个保守B3结构功能域的亲水性不稳定蛋白,相对分子量为65.4kD,等电点为6.54,可能存在2个跨膜区域。蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,蛋白质同源分析发现番茄LeABI3和马铃薯vp1-ABI3类蛋白相似度最高,同源性为89%。