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基于微阵列数据构建基因调控网络

Constructing gene regulatory network from microarray data

作     者:刘万霖 李栋 朱云平 贺福初 LIU Wan-Lin;LI Dong;ZHU Yun-Ping;HE Fu-Chu

作者机构:蛋白质组学国家重点实验室北京蛋白质组研究中心北京放射医学研究所北京100850 

出 版 物:《遗传》 (Hereditas(Beijing))

年 卷 期:2007年第29卷第12期

页      面:1434-1442页

核心收录:

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基  金:国家重点基础研究发展规划(973计划)项目(编号:2006CB910802 2006CB910706) 国家高技术研究发展计划项目(863计划)资助(编号:2006AA02A312)~~ 

主  题:微阵列时间序列 基因调控网络 贝叶斯网络 布尔网络 

摘      要:随着微阵列数据的快速增长,微阵列基因表达数据日益成为生物信息学研究的重要数据源。利用微阵列基因表达数据构建基因调控网络也成为一个研究热点。通过构建基因调控网络,可以解读复杂的调控关系,发现细胞内的调控模式,并进而在系统尺度上理解生物学进程。近年来,人们引入了多种算法来利用基因芯片数据构建基因调控网络。文章回顾了这些算法的发展历史,尤其是其在理论和方法上的改进,给出了一些相关的软件平台,并预测了该领域可能的发展趋势。

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