大鲵2个驯养群体ITS2遗传多样性分析
Analysis of ITS2 genetic diversity between two acclimation populations of Chinese giant salamander,Andrias davidianus作者机构:重庆水产研究所重庆401121 重庆文理学院永川402160
出 版 物:《安徽农业大学学报》 (Journal of Anhui Agricultural University)
年 卷 期:2012年第39卷第1期
页 面:36-40页
学科分类:090801[农学-水产养殖] 0710[理学-生物学] 0908[农学-水产] 07[理学] 09[农学] 071002[理学-动物学]
基 金:2010重庆市科委基本科研业务费支助项目(CH001) 重庆市水产研究所支助项目共同资助
主 题:Andrias davidianus 大鲵 ITS2 遗传多样性 资源保护
摘 要:对大鲵(Andrias davidianus)2个驯化种群的核DNA进行PCR扩增,获得大鲵核DNA上编码核糖体5.8S rRNA和28S rRNA基因的部分序列和完整的ITS2序列(606 bp)。运用DNA分析软件对大鲵2个驯养种群(重庆水产研究所长寿湖珍稀鱼类繁育中心及广汉珍稀鱼类养殖公司)进行了遗传多样性分析。结果显示,该序列平均T、C、A、G含量分别为15.6%、36.5%、12.5%和35.4%,其中G、C的含量C+G(平均为71.9%)显著高于A、T含量A+T(平均为28.1%)。所测序列中有271个碱基发生颠换,112个碱基发生转换,转换与颠换比值(Si/Sv)为0.41,颠换大于转换。10个体均为单倍型,单倍型多样度(H)均为1.000 0±0.126 0,平均核苷酸差异系数(K)为5.932 1±0.861 4,核苷酸多样性(Pi)为0.631 9±0.013 9。种群遗传分化度(Fst)为0.030 5,中性检验及聚类分析表明2个群体没有分化成单一的群体,2个驯养种群遗传多样性好。