牙鲆MHC class ⅡB基因多态性及其与鱼体抗病力关系的分析

作     者：张玉喜 陈松林 ZHANG Yu-xi~(1,2),CHEN Song-lin~1 (1. Key Lab for Sustainable Utilization of Marine Fisheries Resources of the Ministry of Agriculture, Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071,China;2.College of Marine Life Science, Ocean University of China,Qingdao 266003,China)

作者机构：中国水产科学院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 中国水产科学院黄海水产研究所农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 山东青岛266071 中国海洋大学海洋生命学院 山东青岛266003 

出 版 物：《水产学报》 (Journal of Fisheries of China)

年 卷 期：2006年第30卷第5期

页      面：633-639页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家重点基础研究发展规划(973)项目(2004B117403) 国家863项目(2002AA626010) 国家自然科学基金项目(30413240) 

主　　题：主要组织相容性复合体 MHCⅡ多态性 抗病力 牙鲆 

摘      要：用fmhcN1和fmhcC1引物分别从42尾感病个体和42尾抗病个体的基因组DNA中扩增MHC基因片段,扩增产物长度为268/280 bp。在268/280 bp的核苷酸序列中,有32个(11.4%)核苷酸位点是多态的。在其编码的61个氨基酸位点中,有13个位点是多态的,其中有6个位点发生在多肽结合位点上。对核苷酸替代的类型及位点进行分析,发现非多肽结合位点的非同义碱基替代率与同义碱基替代率的比值(dN/dS)(0.523)远远小于多肽结合位点的非同义碱基替代率与同义碱基替代率的比值(dN/dS)(23.091),表明氨基酸替换集中出现在exon2多肽结合位点上。分析84个个体的411个阳性克隆的测序结果,发现有13个不同的MHC classⅡB等位基因,并且分别编码13个不同的氨基酸序列。其中大部分等位基因如a,b,c,d,e,f,j,k,i,m是两个群体共有的,等位基因d在感病群体中出现的频率(23.80%)显著高于在抗病群体中出现的频率(7.14%)。而等位基因g和h只出现在13个抗病个体中,其频率分别为21.4%和9.52%;等位基因l只出现在感病群体中,其频率为19.05%。