融合智能检测的DNA序列预处理新方法
Novel approach for DNA sequence preprocessing with intelligent detection作者机构:重庆大学计算机学院重庆400044 重庆广播电视大学理工学院重庆400052
出 版 物:《重庆大学学报(自然科学版)》 (Journal of Chongqing University)
年 卷 期:2011年第34卷第6期
页 面:132-136页
核心收录:
学科分类:0808[工学-电气工程] 0809[工学-电子科学与技术(可授工学、理学学位)] 08[工学] 0805[工学-材料科学与工程(可授工学、理学学位)] 0813[工学-建筑学] 0814[工学-土木工程] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)] 081202[工学-计算机软件与理论]
基 金:中国博士后科学基金资助项目(20070420711) 重庆市科委自然科学基金计划资助项目(2007BB2372)
摘 要:提出一种融合智能检测的DNA序列预处理新方法。该方法不需要预先给出载体序列、剪接位点和克隆适配片段等信息,通过统计分析、随机搜索和构建图操作等方法自动发现并定位垃圾信息。以Zebrafish DNA序列为样本进行的预处理实验结果证明该方法能够显著提高DNA序列预处理的效率和准确性,在处理超长序列时更稳定、错误率更低。