利用基因YKT6鉴定疫霉属的不同种(英文)
Identification of Phytophthora Species by Specific Primers Derived from YKT6 Gene作者机构:安徽省农业科学院植物保护与农产品质量安全研究所 农业部合肥作物有害生物科学观测实验站 缅甸教育部研究与创新部生物技术研究系
出 版 物:《植物病理学报》 (Acta Phytopathologica Sinica)
年 卷 期:2019年第49卷第1期
页 面:43-55页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学]
基 金:Anhui Provincial Natural Science Foundation(1508085MC43) The National Key Research and Development Program of China(2016YFD0200207)
摘 要:利用分子标记或对特异位点的碱基序列进行分析是植物病原物分子检测的基础,可以在属和种的水平上对物种进行区分和鉴定。对疫霉属的不同种已有一系列的分子检测方法。SNARE蛋白相关基因YKT6拥有保守的侧翼编码区,适于设计疫霉属特异性的PCR引物,同时其内含子所具有的多态性可开发出几乎所有疫霉种的分子标记。利用疫霉属特异性引物对P-YKT6-F/P-YKT6-R可在31个疫霉种中特异地扩增出一条约600 bp的条带,而在腐霉或其他真菌中不能扩增出该条带。利用大豆疫霉的引物对Ps-YKT6-F/Ps-YKT6-R和辣椒疫霉的引物对Pc-YKT6-F/Pc-YKT6-R,能分别从大豆疫霉菌株和辣椒疫霉菌株中扩增出一条399 bp和282 bp的条带,常规PCR和巢式PCR的灵敏度分别达到100 pg和10 fg。利用这些引物也可从土壤和病组织中检测到目标病原菌。此外,利用上述特异性引物开发出了大豆疫霉和辣椒疫霉的实时定量PCR检测方法。基于YKT6基因的分子标记和检测方法可用于疫霉种的调查检测和法定定量检测。