牛源cathelicidin类抗菌肽的生物信息学分析
Bioinformatic analysis of bovine cathelicidin antimicrobial peptides作者机构:河南省新乡市农业农村局河南新乡453003 河南科技学院动物科技学院河南新乡453003
出 版 物:《河南科技学院学报(自然科学版)》 (Journal of Henan Institute of Science and Technology(Natural Science Edition))
年 卷 期:2019年第47卷第1期
页 面:37-42页
基 金:河南省自然科学基金项目(182300410031) 河南科技学院高层次人才启动项目(2014020) 河南科技学院大学生创新训练项目(2018CX88) 河南科技学院大学生"百农英才"创新项目(BNYC2017-2-17)
主 题:抗菌肽 牛 cathelicidin 生物信息学
摘 要:为研究牛源cathelicidin类抗菌肽的生物学功能,通过生物信息学方法对牛源cathelicidin类抗菌肽的理化性质、信号肽、跨膜区、亚细胞定位、二级结构和化学修饰等进行预测分析.结果表明:牛源cathelicidin类抗菌肽为阳离子型抗菌肽,等电点11.53~13.20;除了BMAP-27和Dodecapeptide为稳定的多肽外,其他抗菌肽均为不稳定多肽;BMAP-28和Dodecapeptide为疏水性多肽,BMAP-27、BMAP-34、Bac-4、Bac-5、Bac-7和Indolicidin为亲水性多肽;BMAP-27和BMAP-28由α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲构成,BMAP-34主要由α螺旋和β转角构成,Bac4、Bac7、Indolicidin和Dodecapeptide由无规则卷曲构成,Bac5由β转角和无规则卷曲构成;没有信号肽、跨膜区和糖基化位点,BMAP-27、BMAP-28和BMAP-34各存在1个丝氨酸的磷酸化位点.根据分析结果推测牛源cathelicidin类抗菌肽可作用于细菌的细胞壁或细胞膜,进而导致细菌死亡.