S1基因结构解析与分子进化分析
Structural Analysis and Molecular Evolution of S1 Gene作者机构:岭南师范学院生命科学与技术学院湛江524048 华南农业大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室广州510642
出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)
年 卷 期:2019年第17卷第2期
页 面:458-465页
基 金:国家自然科学基金(31101137) 广东省公益研究与能力建设专项(2016A020209011 2017A020208074)共同资助
摘 要:S1是水稻(Oryza sativa L.)亚非栽培稻种间杂种不育一个最重要的基因座,对杂种的雌雄配子都有选择性杀灭作用。前期我们通过图位克隆获得S1基因座的候选基因后,NCBI查找发现‘日本晴’的S1等位基因序列全长7 kb,局倍区域有高GC分布。为此本研究通过分多段运用有针对性的PCR方法,对所用的材料IRAT216与IRAT216S1进行了扩增并测序,获得了各自的S1全长序列,并进行了比对,发现IRAT216与‘日本晴’的序列完全相同,但IRAT216与IRAT216S1之间存在多处变异。同时针对有效变异区对S1基因进行了分子进化调查,建立了水稻的分子进化树,确定了S1在物种进化中的意义。本研究的S1基因序列测定,将为水稻分子标记辅助育种中分子标记的开发提供序列参照,同时也将为S1基因RNA的表达分析与蛋白功能研究、在各物种中的分化变异和水稻在进化中地位划分提供理论依据,并能为水稻的起源研究提供参考。