基于microRNA测序分析miRNA在刺葡萄抗白腐病中的作用

作     者：张颖 樊秀彩 姜建福 李民 刘崇怀 ZHANG Ying;FAN Xiucai;JIANG Jianfu;LI Min;LIU Chonghuai

作者机构：中国农业科学院郑州果树研究所郑州450009 

出 版 物：《果树学报》 (Journal of Fruit Science)

年 卷 期：2019年第36卷第2期

页      面：143-152页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 090402[农学-农业昆虫与害虫防治] 

基　　金：国家自然科学基金面上项目(31872057) 中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2018-ZFRI) 现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-29-yz-1) 中央级科研院所基本科研业务费 农业部作物种质资源保护项目(NB2130135-34) 

主　　题：葡萄白腐病 microRNA 抗病 测序 

摘      要：【目的】在前期的种质资源评价过程中,发掘一株中国野生刺葡萄0943,该株系高抗葡萄白腐病。基于mi-croRNA(miRNA)在植物抗病中的重要作用,拟从miRNA水平探讨刺葡萄在受到病原菌侵染后的表达调控机制。【方法】以抗病的中国野生刺葡萄为试材,对比感病的欧亚种 美人指’,分别以病原菌诱导,在0 hpi(hours post inoculation)和病菌诱导后的12 hpi、36 hpi处理后采样,进行二代测序,并对数据进行KEGG及表达量的差异分析。【结果】对比感病葡萄 美人指’,分析了抗病刺葡萄在基础代谢和抗病途径中的差异,结合miRNA的表达量,获得了150个表达量发生变化的miRNA,其中44个miRNA的表达在刺葡萄和 美人指’之间存在差异。5个miRNA在刺葡萄中特异表达,但是在 美人指’中不表达,实施定量验证了这一结果。靶基因预测显示,其靶基因包括与抗病的紧密相关的WRKY、SPL、EFR等转录因子,还包括与抗病直接相关的LRR类的抗病基因。【结论】筛选出5个在刺葡萄上特异表达候选miRNA(miR172a、miR172b、miR845a、novel_81和miR159a),可作为刺葡萄抗白腐病研究的目标。