丹参晚期胚胎蛋白基因SmLEA的克隆及表达分析

作     者：刘丛玲 王喆之 Liu Congling;Wang Zhezhi

作者机构：陕西师范大学生命科学学院药用植物资源与天然药物化学教育部重点实验室西北濒危药材资源开发国家工程实验室西安710062 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2009年第25卷第5期

页      面：80-84页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

主　　题：晚期胚胎丰富蛋白 生物信息学 组成型基因 丹参 

摘      要：对丹参EST序列进行Blast分析,发现一条序列与晚期胚胎丰富蛋白(late embryogenesis abundant)基因有较高的相似性,在此基础上设计引物,分别从cDNA和gDNA水平克隆到该基因的全长(Genbank注册号:AY725206),命名为SmLEA。该序列全长739 bp,无内含子,包含1个长为495 bp的开放阅读框,编码164个氨基酸。序列比对结果显示,该序列与番茄的晚期胚胎丰富蛋白Lemmi9有较高的相似性(69%),推测该编码蛋白属于晚期胚胎蛋白LEA14家族成员。生物信息学显示,SmLEA所编码蛋白SmLEA的相对分子质量为17.34 kD,理论等电点为4.51,富含天冬氨酸及AS、IP、KV、VS、TIP肽段,定位于细胞质中,为稳定类蛋白。实时荧光定量PCR结果显示,该基因在丹参的根、茎、叶中均有表达,为组成型表达基因。