鲈形目线粒体DNA蛋白编码基因的适用性分析

作     者：郭昱嵩 王中铎 焦阳 刘楚吾 

作者机构：广东海洋大学水产学院广东湛江524025 

出 版 物：《安徽农业科学》 (Journal of Anhui Agricultural Sciences)

年 卷 期：2009年第37卷第16期

页      面：7355-7358,7360页

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30671610) 国家科技支撑计划项目(2007BAD29B03) 

主　　题：鲈形目 线粒体DNA 蛋白编码基因 系统进化 

摘      要：[目的]对线粒体DNA 13种蛋白质编码基因的系统进化分析能力进行了评估。[方法]单个基因和基因拼接序列比较,综合考虑序列的信息量和邻位连接法构建系统进化树的置信度。[结果]按分类阶元不同将基因都分成不同的4等。在鲈形目的科间阶元,最好的为ND6和cox2;好的序列为ND5和ND4;ND4L、ND3和ATP8差;包括Cyt b、cox1在内的其余6种基因为中等;在属内种间阶元,最好的为ATP6和cox2;好的序列为ND2和cox1;ND6、ND3和ATP8差;包括Cyt b在内的其余6种基因为中等。另外,分析揭示序列长度的增加可以提高系统进化树的置信度,且属内物种间比较时序列长度的影响小于高级阶元。[结论]线粒体DNA蛋白质编码基因的信息分布具不均一性,需分类阶元选择最佳基因和组合。